As empresas de fabricação de alimentos iniciantes em segurança alimentar ou aquelas com sistemas de segurança alimentar subdesenvolvidos serão guiadas por uma exploração de sete programas fundamentais que, junto com seu plano de segurança alimentar, compõem o Código Fundamental do SQF. Esses sete programas fundamentais são:
A conclusão de uma aula de APPCC ou PCQI não é necessária, mas é altamente recomendada.